Tuhoaa solun rakenteen

Kaspaasi voi suoraan tuhota solurakenteen, kuten halkeaa ydinkuitukerroksen. Ydinkuitukerros (Lamina) on polymeeri, joka on yhdistetty päähän häntään ydinkuitukerroksen proteiinin polymeroinnilla ja muodostaa siten ydinkalvon runkorakenteen, jotta kromatiini voidaan muodostaa ja järjestyä normaalisti. Soluapoptoosin prosessissa kaspaasi murtaa substraattina olevan laminiinin kiinteässä kohdassa lähellä keskustaa, mikä johtaa laminiinin hajoamiseen ja solukromatiinin kondensoitumiseen.